Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRRC1Q96M27 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms