Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COG3Q96JB2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms