Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC124Q96CT7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC124Q96CT7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms