Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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