Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms