Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms