Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms