Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms