Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LINC00518Q8N0U6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LINC00518Q8N0U6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LINC00518Q8N0U6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LINC00518Q8N0U6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LINC00518Q8N0U6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00518Q8N0U6 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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LINC00518Q8N0U6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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LINC00518Q8N0U6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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LINC00518Q8N0U6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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LINC00518Q8N0U6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00518Q8N0U6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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