Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLNKQ7Z7G1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms