Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms