Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4L3Q6VB84 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4L3Q6VB84 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms