Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms