Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHKAPQ2M3C7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHKAPQ2M3C7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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