Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPRNQ16849 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPRNQ16849 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPRNQ16849 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PTPRNQ16849 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PTPRNQ16849 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PTPRNQ16849 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PTPRNQ16849 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRNQ16849 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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