Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIF1AQ16665 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIF1AQ16665 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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