Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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