Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDC37Q16543 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDC37Q16543 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms