Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA3Q16281 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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