Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCOA1Q15788 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms