Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDCD1Q15116 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDCD1Q15116 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PDCD1Q15116 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PDCD1Q15116 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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