Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTTNQ14247 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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