Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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