Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATMQ13315 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATMQ13315 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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