Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN3Q13064 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN3Q13064 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms