Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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STRN3Q13033 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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STRN3Q13033 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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