Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PTP4A2Q12974 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PTP4A2Q12974 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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