Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF5AQ12840 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms