Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms