Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms