Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms