Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms