Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms