Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPCQ01831 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPCQ01831 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms