Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2C1P98194 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms