Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-24P63145 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms