Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3P61158 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms