Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA9P57773 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms