Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLTPP55058 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLTPP55058 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms