Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms