Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRPC1P48995 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRPC1P48995 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms