Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABRA4P48169 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms