Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ATRXP46100 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATRXP46100 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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