Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A2P43354 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms