Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms