Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms