Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA11P31270 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms