Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms