Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms