Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSSP25774 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSSP25774 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSSP25774 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTSSP25774 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSSP25774 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms